转录因子调控分析

蛋白相互作用位点分析

小RNA的靶基因预测及功能分析

甲基化、磷酸化位点预测分析

RNA转录后会发生各种修饰，包括N6-腺苷酸甲基化（N6-methyladenosine，m6A）、胞嘧啶羟基化（m5C）、N1-腺苷酸甲基化（m1A）等，其中m6A甲基化是真核生物RNA中最常见的一种转录后修饰，大约占到了RNA甲基化修饰的80%左右。

芊陌生物可提供多种工具对m6A位点进行预测分析，如M6AMRFS、M6APred-EL、DeepM6Aseq，并通过m6Acomet进一步对m6A甲基化的功能进行注释。

蛋白质磷酸化是生物界最普遍，也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰。在细胞中，大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关，如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化位点的检测和分析对于理解生物学过程和疾病发生机理非常重要。磷酸化主要集中在丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸 残基上，这些残基上具有游离的羟基，且本身不带电荷，当磷酸化后蛋白质便具有了电荷，从而使结构发生变化，进一步引起蛋白质活性的变化。

芊陌生物可基于目标蛋白的氨基酸序列进行磷酸化位点的预测分析，使用的分析工具包括：NetPhos、GPS和MμsiteDeep等工具。